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Seven pairs of oat near-isogenic lines (NILs) (Kibite in Crop Sci 41:277–278, 2001) contrasting for the Dw6 dwarfing gene were used to test for correlation between tall/dwarf phenotype and polymorphic genotype using restriction fragment length polymorphism (RFLP) and other molecular markers selected from the Kanota × Ogle (K×O) (Wight et al. in Genome 46:28–47, 2003) and Terra × Marion (De Koeyer et al. in Theor Appl Genet 108:1285–1298, 2004) recombination maps. This strategy located the Dw6/dw6 locus to a small chromosomal region on K×O linkage group (LG) KO33, near or at a putative RFLP locus aco245z.
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Nous avons utilisé sept paires de lignées quasi-isogéniques d’avoine (NIL, pour near-isogenic lines) [Kibite, in Crop Sci 41:277–278, 2001) contrastées pour le caractère de nanisme codé par le gène Dw6 pour vérifier la corrélation entre le phénotype normal/nain et le génotype polymorphe à l’aide du polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP) et des marqueurs moléculaires choisis dans les cartes de recombinaison de Kanota × Ogle (K×O) (Wight et al. in Genome 46:28–47, 2003) et de Terra × Marion (De Koeyer et al. in Theor Appl Genet 108:1285–1298, 2004). Cette stratégie nous a permis de déterminer l’emplacement du locus Dw6/dw6 dans une petite région chromosomique du groupe de liaison K×O, KO33, près du locus RFLP présumé aco245z ou à ce locus. Le marqueur Aco245z et d’autres marqueurs flanquants étroitement liés peuvent être utiles dans la sélection assistée par marqueurs, et plusieurs d’entre eux nous ont servi à préparer des marqueurs PCR. Le génotypage par RFLP des NIL Dw6 a révélé que 13 des 14 lignées présentaient une homologie maternelle ou paternelle pour une grande région du génome près du locus Dw6/dw6, un résultat inattendu dans des NIL. Le clone d’ADNc aco245 code la sous-unité H d’une ATPase à protons vacuolaire, un gène candidat pour le nanisme Dw6. Les ATPases à protons vacuolaires jouent un rôle crucial dans la croissance et le développement des plantes. Une mutation dans la sous-unité C (det3) de ces enzymes entraîne le nanisme chez Arabidopsis thaliana (Schumacher et al. in Genes Dev 13:3259–3270, 1999).Le locus Aco245 permet de concevoir des marqueurs de diagnostic précis pour la sélection assistée par marqueurs du gène Dw6. Les NIL Dw6 peuvent servir à étudier le rôle des ATPases à protons vacuolaires dans la croissance et le développement des plantes.
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