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La PCR en temps réel est réalisée en utilisant des épreuves internes de différenciation moléculaire avec trois cibles spécifiques de Francisella tularensis. Une de ces trois cibles permet de faire une distinction entre les souches de type A et les souches de type B. Les tests de confirmation d'un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour F. tularensis comprennent les suivants : épreuve d'immunofluorescence directe, agglutination sur lame, analyse multilocus du polymorphisme des séquences répétées en tandem (MLVA), analyse des acides gras cellulaires (AGC) et séquençage du gène codant l'ARNr 16S. Tous les échantillons dont les résultats de PCR en temps réel sont négatifs pour F. tularensis sont soumis à une analyse des AGC et à un séquençage du gène codant l'ARNr 16S, pourvu que l'échantillon permette d'étudier la croissance bactérienne par culture.
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