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Le processus excréteur chez les panopes (ainsi que chez la plupart des bivalves) se déroule dans le complexe cour-rein (Figure 1a) qui s'étend dans la masse viscérale ventralement à la charnière et légèrement derrière l'umbo (voir le schéma anatomique pour en identifier la position). Le rein (néphridies ou organes de Bojanus) peut être représenté comme deux tubes parallèles constitués d'un segment aglandulaire proximal et d'un segment glandulaire distal qui s'est replié sur lui-même de sorte que les deux tubes aglandulaires sont enveloppés des deux lobes fusionnés du segment glandulaire (Figure 1b). Ainsi, le rein forme une grosse glande, fortement plissée, qui occupe une position ventrale par rapport au rectum et une position postéro-ventrale par rapport au péricarde (Figures 1b et 1c). La glande péricardique (un organe de couleur brun-rouge ou glande de Keber) localisée en grande partie sur la surface des oreillettes (Figure 2a) filtre l'hémolymphe. Le filtrat s'accumule dans l'espace péricardique d'où il s'écoule dans les reins au moyen de deux courts conduits néphridiens, un de chaque côté du corps. À l'intérieur des reins, les substances contenues dans le filtrat sont résorbées à la surface apicale (interne) des cellules rénales et emmagasinées dans les cellules rénales ou retournées dans l'hémolymphe qui baigne les surfaces externes de l'épithélium rénal. De plus, les hémocytes contenus dans l'hémolymphe environnante conduisent les déchets aux cellules rénales et ces déchets sont expulsés dans la lumière du rein par sécrétion apocrine (Morse et Zardus 1997). L'effluent sort des reins au moyen de deux pores néphridiens (néphridiopores) qui s'ouvrent, ainsi que les gonades, dans la cavité palléale (Martin 1983).
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