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  Department of Fisheries...  

Show textShow cached sourceOpen source URL	Validation of a quantitative RT-PCR assay to detect infectious pancreatic necrosis virus
Compare text pagesCompare HTM pagesOpen source URLOpen target URLDefine dfo-mpo.gc.ca as primary domain	Patdogènes viraux chez la forme nordique du Dolly Varden

  Moncton lab validates a...  

Show textShow cached sourceOpen source URL	(MSX), a pathogen affecting oysters in Canada. Assays for ISAV and MSX include a regular RT-PCR and a real-time RT-PCR assay. For MSX, histopathological detection is validated, and for ISAV, a viral assay is part of the validation.
Compare text pagesCompare HTM pagesOpen source URLOpen target URLDefine dfo-mpo.gc.ca as primary domain	(MSX), un pathogène touchant les huîtres au Canada. Les dosages pour le VAIS et le MSX incluent un dosage RT-PCR régulier et un dosage RT-PCR en temps réel. Dans le cas du MSX, la détection histopathologique est validée, et dans le cas du VAIS, un dosage viral fait partie de la validation.

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Show textShow cached sourceOpen source URL	(MSX), a pathogen affecting oysters in Canada. Assays for ISAV and MSX include a regular RT-PCR and a real-time RT-PCR assay. For MSX, histopathological detection is validated, and for ISAV, a viral assay is part of the validation.
Compare text pagesCompare HTM pagesOpen source URLOpen target URLDefine dfo-mpo.gc.ca as primary domain	(MSX), un pathogène touchant les huîtres au Canada. Les dosages pour le VAIS et le MSX incluent un dosage RT-PCR régulier et un dosage RT-PCR en temps réel. Dans le cas du MSX, la détection histopathologique est validée, et dans le cas du VAIS, un dosage viral fait partie de la validation.

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Show textShow cached sourceOpen source URL	Obtaining high quality, intact RNA is the first and often the most critical step in performing many fundamental molecular biology experiments, including Northern analysis, nuclease protection assays, RT-PCR, RNA mapping, in vitro translation and cDNA library construction.
Compare text pagesCompare HTM pagesOpen source URLOpen target URLDefine dfo-mpo.gc.ca as primary domain	Courte séquence d'ADNc (200 à 500 paires de bases) obtenue d'un ARNm dérivé d'une population particulière de cellules et utilisée pour le clonage d'un grand nombre de gènes exprimés dans cette population. Également désigné étiquette de séquence exprimée.

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Initial laboratory testing has suggested that use of the reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay could reduce the time required for diagnosis of IHN to 48 hours from the time of sample collection.

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D'après les résultats de premiers essais en laboratoire, l'utilisation de la réaction de polymérisation en chaîne par la transcriptase inverse (RT-PCR) pourrait permettre de réduire le temps requis pour poser un diagnostic de NHI à 48 heures, à partir du moment de la collecte des échantillons. Notre objectif était d'évaluer la méthode RT-PCR en utilisant des échantillons prélevés sur le terrain pour établir sa fiabilité comme outil de dépistage plus rapide du vNHI chez le saumon d'élevage.

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Initial laboratory testing has suggested that use of the reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay could reduce the time required for diagnosis of IHN to 48 hours from the time of sample collection.

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D'après les résultats de premiers essais en laboratoire, l'utilisation de la réaction de polymérisation en chaîne par la transcriptase inverse (RT-PCR) pourrait permettre de réduire le temps requis pour poser un diagnostic de NHI à 48 heures, à partir du moment de la collecte des échantillons. Notre objectif était d'évaluer la méthode RT-PCR en utilisant des échantillons prélevés sur le terrain pour établir sa fiabilité comme outil de dépistage plus rapide du vNHI chez le saumon d'élevage.

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Fish from 3 farm sites were tested for IHNv and the reliability of RT-PCR for IHNv detection, its performance was compared to the VI test. The performance of RT-PCR on fresh or frozen samples was equivalent to that of VI.

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Nous avons fait des tests de dépistage du vNHI chez des poissons provenant de trois fermes et évalué la fiabilité de la méthode RT-PCR pour ce qui est de dépister le vNHI, puis nous avons comparé sa performance au test d'isolement du virus. La performance de la méthode RT-PCR sur des échantillons frais ou congelés et du test d'isolement du virus était équivalente. Étant donné que les signes cliniques de la maladie et les premiers cas de mortalité se manifestent peu de temps après l'exposition du poisson au vNHI, le délai de diagnostic plus court qu'offre la méthode RT-PCR permettra de modifier plus rapidement les mesures de gestion des élevages, ce qui pourrait réduire la propagation de la maladie.

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Fish from 3 farm sites were tested for IHNv and the reliability of RT-PCR for IHNv detection, its performance was compared to the VI test. The performance of RT-PCR on fresh or frozen samples was equivalent to that of VI.

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Nous avons fait des tests de dépistage du vNHI chez des poissons provenant de trois fermes et évalué la fiabilité de la méthode RT-PCR pour ce qui est de dépister le vNHI, puis nous avons comparé sa performance au test d'isolement du virus. La performance de la méthode RT-PCR sur des échantillons frais ou congelés et du test d'isolement du virus était équivalente. Étant donné que les signes cliniques de la maladie et les premiers cas de mortalité se manifestent peu de temps après l'exposition du poisson au vNHI, le délai de diagnostic plus court qu'offre la méthode RT-PCR permettra de modifier plus rapidement les mesures de gestion des élevages, ce qui pourrait réduire la propagation de la maladie.

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Fish from 3 farm sites were tested for IHNv and the reliability of RT-PCR for IHNv detection, its performance was compared to the VI test. The performance of RT-PCR on fresh or frozen samples was equivalent to that of VI.

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Nous avons fait des tests de dépistage du vNHI chez des poissons provenant de trois fermes et évalué la fiabilité de la méthode RT-PCR pour ce qui est de dépister le vNHI, puis nous avons comparé sa performance au test d'isolement du virus. La performance de la méthode RT-PCR sur des échantillons frais ou congelés et du test d'isolement du virus était équivalente. Étant donné que les signes cliniques de la maladie et les premiers cas de mortalité se manifestent peu de temps après l'exposition du poisson au vNHI, le délai de diagnostic plus court qu'offre la méthode RT-PCR permettra de modifier plus rapidement les mesures de gestion des élevages, ce qui pourrait réduire la propagation de la maladie.

  Researching resistance  

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This is the first evidence of a multidrug efflux pump in sea lice which will allow detection of upregulation, should resistance to emamectin benzoate develop. P-GP expression in sea lice is being examined using realtime RT-PCR which will be an excellent tool for measurement of P-GP upregulation.

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Il s'agit de la première preuve de l'existence d'une pompe-efflux chez le pou du poisson lui conférant une résistance à plusieurs agents chimiothérapeutiques, ce qui permettra de déceler la régulation en amont de la P-GP s'il se développe une résistance au benzoate d'emamectine. Nous étudions l'expression du gène de la P-GP chez le pou en utilisant la RT-PCR en temps réel, qui s'est révélée un excellent outil pour la mesure de la régulation en amont de la P-GP. Nous avons également identifié les gènes codant pour les sites d'action de l'avermectine, soit les canaux chlorure activés par le GABA et le glutamate.

  Population Dynamics - D...  

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A reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) test was developed to detect a portion of the nucleocapsid gene found only in PDV. This RT-PCR methodology was used to confirm the identity of the virus that was subsequently isolated from the ferrets.

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Une méthode d'amplification en chaîne par polymérase avec transcription inverse a été mise au point pour déceler une partie du gène du capside nucléique présent uniquement dans le VMC. Cette méthode a été utilisée pour confirmer l'identité du virus qui a par la suite été isolé chez les furets. Les isolats viraux des furets infectés ainsi que les virus isolés au départ chez un dauphin et un marsouin et maintenus dans des cellules Vero se sont aussi reproduits plus vite et ont produit des titres plus élevés de virus lorsqu'ils se sont propagés dans les cellules Vero.DogSLAMtag.

  Dynamic of haemic neopl...  

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Our study focuses, in a first attempt, on expression of p53 and p73 genes in leukaemic clams. An HN positive clam population is monitored by western blots and quantitative RT PCR. Detection of mutation is based on SSCP and western blot using monoclonal antibody Pab240.

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Notre étude est d'abord axée sur l'expression des gènes p53 et p73 chez les myes leucémiques. Une population de mye atteinte de la NH est surveillée au moyen de transferts Western et de réactions en chaîne de la polymérase quantitative (transcriptase inverse). La détection de mutations est fondée sur le polymorphisme de conformation des ADN simples brins et un transfert Western au moyen de l'anticorps monoclonal Pab240. Notre principal objectif est, en bout de ligne, d'identifier les éléments moléculaires qui jouent un rôle dans le développement de la leucémie.

  Population Dynamics - D...  

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A reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) test was developed to detect a portion of the nucleocapsid gene found only in PDV. This RT-PCR methodology was used to confirm the identity of the virus that was subsequently isolated from the ferrets.

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Une méthode d'amplification en chaîne par polymérase avec transcription inverse a été mise au point pour déceler une partie du gène du capside nucléique présent uniquement dans le VMC. Cette méthode a été utilisée pour confirmer l'identité du virus qui a par la suite été isolé chez les furets. Les isolats viraux des furets infectés ainsi que les virus isolés au départ chez un dauphin et un marsouin et maintenus dans des cellules Vero se sont aussi reproduits plus vite et ont produit des titres plus élevés de virus lorsqu'ils se sont propagés dans les cellules Vero.DogSLAMtag.

  Exposing Atlantic cod t...  

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In this project, we injected juvenile cod with either a NNV isolated from haddock (known to cause disease in cod), or the striped bass isolate. Fish were sampled every month for one year and their tissues (spleen, kidney, eye, brain, blood) were tested for the presence of nodavirus by virology and RT-PCR.

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Nous avons injecté à des morues juvéniles un isolat du virus de la nécrose nerveuse provenant soit de l'aiglefin (isolat reconnu pour causer la maladie chez la morue) ou du bar rayé. Les sujets ont été échantillonnés chaque mois pendant un an. Les tissus prélevés (rate, rein, yeux, cerveau, sang) ont été soumis à un examen virologique et à des épreuves PCR-CDNA pour établir si le nodavirus était présent. Nous avons également conçu une nouvelle épreuve PCR-CDNA pour mieux apparier les séquences du virus. Les résultats préliminaires montrent que l'isolat prélevé chez le bar rayé ne cause pas de mortalité chez la morue, mais celle-ci a montré des résultats positifs aux tests de détection du virus plus d'un an après y avoir été exposé.

  Exposing Atlantic cod t...  

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In this project, we injected juvenile cod with either a NNV isolated from haddock (known to cause disease in cod), or the striped bass isolate. Fish were sampled every month for one year and their tissues (spleen, kidney, eye, brain, blood) were tested for the presence of nodavirus by virology and RT-PCR.

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Nous avons injecté à des morues juvéniles un isolat du virus de la nécrose nerveuse provenant soit de l'aiglefin (isolat reconnu pour causer la maladie chez la morue) ou du bar rayé. Les sujets ont été échantillonnés chaque mois pendant un an. Les tissus prélevés (rate, rein, yeux, cerveau, sang) ont été soumis à un examen virologique et à des épreuves PCR-CDNA pour établir si le nodavirus était présent. Nous avons également conçu une nouvelle épreuve PCR-CDNA pour mieux apparier les séquences du virus. Les résultats préliminaires montrent que l'isolat prélevé chez le bar rayé ne cause pas de mortalité chez la morue, mais celle-ci a montré des résultats positifs aux tests de détection du virus plus d'un an après y avoir été exposé.

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Wild populations of various fish including salmon and cultured fish will be assayed for viruses including ISAV, IPNV, VHSV and IHNV using classical cell culture methods and molecular based techniques (e.g., RT-PCR).

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Il importe d'adopter une démarche proactive pour détecter la présence de virus dans les populations de poissons sauvages, pour ensuite déterminer la pathogénicité des virus détectés. Or les méthodes classiques de détection des virus par cultures cellulaires comportent des limites, qui sont liées au fait que les virus des poissons ont des préférences pour certaines lignées cellulaires; il est donc essentiel que les techniques de détection moléculaire soient appliquées parallèlement aux cultures cellulaires. Les techniques basées sur la PCR peuvent fournir de précieux renseignements supplémentaires, notamment par l'amplification et le séquençage des fragments du génome viral qui codent pour des protéines particulières, p. ex. des protéines antigéniques. La comparaison des séquences de ces fragments entre diverses souches d'un même virus peut ensuite être liée à la pathogénicité observée in vivo. L'analyse génomique sera également appliquée pour comparer les isolats provenant de différents hôtes et de différentes zones géographiques du Canada.