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The main marker systems in livestock studies are Amplified Fragment Length Polymorphism' (AFPL, combining DNA digestion and polymerase chain reaction PCR amplification), microsatellites (markers in the nuclear DNA), mitochondrial DNA (examination of uniparental clonal inheritance), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), and Copy Number Variation (CNV).
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Des chercheurs de l’École Polytechnique Fédérale de Lausanne, en Suisse, étudient dans quelle mesure les caractéristiques géographiques et environnementales affectent la structure génétique des cheptels dans le monde afin d’établir une corrélation entre les modèles de variation génétique et les variables géographique. Ils explorent le potentiel d’un certain nombre de marqueurs moléculaires différents, à partir de sources génétiques, de l’ADN mitochondrial aux chromosomes Y, pour la génomique des animaux d’élevage. Dans les études réalisées sur des animaux d’élevage, les principaux systèmes de marqueurs sont le polymorphisme de longueur de fragments amplifiés (AFPL, combinant la digestion de l’ADN et l’amplification par réaction de polymérase en chaîne), les microsatellites (marqueurs dans l’ADN nucléaire), l’analyse de l’ADN mitochondrial (analyse des marqueurs à héritage uniparental), les polymorphismes de nucléotides individuels (SNP) et la variation du nombre de copies (CNV). Tout comme les phytogénéticiens, qui analysent les plantes sauvages apparentées et les plantes sous-utilisées afin de découvrir des gènes utiles, les spécialistes de l’élevage ont analysé les génomes de races locales/indigènes afin d’associer des loci uniques avec des paramètres environnementaux. Cet effort peut aider à améliorer les troupeaux très affectés par les changements rapides et constants de l’environnement.
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