braa – -Translation – Keybot Dictionary
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Wilhite, Harold Langford; Elverhøi, Anders; Bakken, Vebjørn; Winther, Tanja;
Braa
, Kristin & Geirbo, Hanne Cecilie (2012). Social impacts of electricity in rural areas.
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Wilhite, Harold Langford (2012). Transformasjon til et lavenergisamfunn: hindringer og behov for nytenkning.
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Considering that diploid Brassica genomes contain three Arabidopsis-like subgenomes, the objectives of the present work were to determine whether PSY gene families exist in B. napus (AACC) and its diploid progenitor species, Brassica rapa (AA) and Brassica oleracea (CC); to establish the level of retention of Brassica PSY genes; to map PSY gene family members in the A and C genomes and to compare Brassica PSY gene expression patterns. A total of 12 PSY homologues were identified, 6 in B. napus (BnaX.PSY.a-f) and 3 in B. rapa (
BraA
.PSY.a-c) and B. oleracea (BolC.PSY.a-c).
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L’étendue de la redondance génomique chez les espèces du genre Brassica permet d’étudier l’évolution des gènes à copies multiples et l’effet de la polyploïdie dans des cultures d’importance économique. L’enzyme phytoène synthase (PSY) catalyze la première réaction de la voie de biosynthèse des caroténoïdes, qui s’avère l’étape limitante dans les graines de Brassica napus. Chez Arabidopsis thaliana, un seul gène codant la PSY (AtPSY) régit la synthèse du phytoène dans tous les tissus. Sachant que les génomes diploïdes de Brassica contiennent trois sous-génomes semblables à ceux d’ Arabidopsis, nous avons voulu 1) voir s’il existe des familles de gènes PSY chez B. napus (AACC) et chez les espèces diploïdes progénitrices de celui-ci, Brassica rapa (AA) et Brassica oleracea (CC); 2) déterminer le niveau de rétention des gènes PSY de Brassica; 3) cartographier les gènes de la famille PSY dans les génomes A et C et 4) comparer les profils d’expression des gènes PSY de Brassica. Nous avons identifié 12 homologues PSY au total, 6 chez B. napus (BnaX.PSY.a-f) et 3 chez B. rapa (BraA.PSY.a-c) ainsi que chez B. oleracea (BolC.PSY.a-c). Avec six membres, B. napus est l’espèce qui contient la plus grande famille de gènes PSY décrite à ce jour. La comparaison des séquences du gène AtPSY et des gènes PSY de Brassica a révélé une structure hautement conservée et des pourcentages d’homologie supérieurs à 85 % sur le plan des séquences codantes. Dans l’ensemble, nos données montrent que l’expansion de la famille des gènes PSY a précédé la spéciation de B. rapa et de B. oleracea, qui remonte à la réplication en trois exemplaires des sous-génomes paralogues. Chez ces trois espèces de Brassica, tous les gènes PSY homologues sont exprimés et présentent une redondance chevauchante ainsi que des signes de sous‑fonctionnalisation dans les tissus photosynthétiques et non photosynthétiques. Ces données viennent appuyer l’hypothèse selon laquelle la divergence fonctionnelle de l’expression des gènes PSY facilite l’accumulation de grandes quantités de caroténoïdes dans les tissus riches en chromoplastes. Ainsi, la rétention fonctionnelle des trois copies de gènes PSY chez Brassica pourrait, partiellement du moins, s’expliquer par l’avantage sélectif des quantités accrues de produit du gène dans les organes floraux. Une meilleure compréhension de la caroténogenèse chez Brassica aidera à la mise au point de cultivars classiques et transgéniques produisant une huile enrichie en caroténo
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Considering that diploid Brassica genomes contain three Arabidopsis-like subgenomes, the objectives of the present work were to determine whether PSY gene families exist in B. napus (AACC) and its diploid progenitor species, Brassica rapa (AA) and Brassica oleracea (CC); to establish the level of retention of Brassica PSY genes; to map PSY gene family members in the A and C genomes and to compare Brassica PSY gene expression patterns. A total of 12 PSY homologues were identified, 6 in B. napus (BnaX.PSY.a-f) and 3 in B. rapa (
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.PSY.a-c) and B. oleracea (BolC.PSY.a-c).
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L’étendue de la redondance génomique chez les espèces du genre Brassica permet d’étudier l’évolution des gènes à copies multiples et l’effet de la polyploïdie dans des cultures d’importance économique. L’enzyme phytoène synthase (PSY) catalyze la première réaction de la voie de biosynthèse des caroténoïdes, qui s’avère l’étape limitante dans les graines de Brassica napus. Chez Arabidopsis thaliana, un seul gène codant la PSY (AtPSY) régit la synthèse du phytoène dans tous les tissus. Sachant que les génomes diploïdes de Brassica contiennent trois sous-génomes semblables à ceux d’ Arabidopsis, nous avons voulu 1) voir s’il existe des familles de gènes PSY chez B. napus (AACC) et chez les espèces diploïdes progénitrices de celui-ci, Brassica rapa (AA) et Brassica oleracea (CC); 2) déterminer le niveau de rétention des gènes PSY de Brassica; 3) cartographier les gènes de la famille PSY dans les génomes A et C et 4) comparer les profils d’expression des gènes PSY de Brassica. Nous avons identifié 12 homologues PSY au total, 6 chez B. napus (BnaX.PSY.a-f) et 3 chez B. rapa (BraA.PSY.a-c) ainsi que chez B. oleracea (BolC.PSY.a-c). Avec six membres, B. napus est l’espèce qui contient la plus grande famille de gènes PSY décrite à ce jour. La comparaison des séquences du gène AtPSY et des gènes PSY de Brassica a révélé une structure hautement conservée et des pourcentages d’homologie supérieurs à 85 % sur le plan des séquences codantes. Dans l’ensemble, nos données montrent que l’expansion de la famille des gènes PSY a précédé la spéciation de B. rapa et de B. oleracea, qui remonte à la réplication en trois exemplaires des sous-génomes paralogues. Chez ces trois espèces de Brassica, tous les gènes PSY homologues sont exprimés et présentent une redondance chevauchante ainsi que des signes de sous‑fonctionnalisation dans les tissus photosynthétiques et non photosynthétiques. Ces données viennent appuyer l’hypothèse selon laquelle la divergence fonctionnelle de l’expression des gènes PSY facilite l’accumulation de grandes quantités de caroténoïdes dans les tissus riches en chromoplastes. Ainsi, la rétention fonctionnelle des trois copies de gènes PSY chez Brassica pourrait, partiellement du moins, s’expliquer par l’avantage sélectif des quantités accrues de produit du gène dans les organes floraux. Une meilleure compréhension de la caroténogenèse chez Brassica aidera à la mise au point de cultivars classiques et transgéniques produisant une huile enrichie en caroténo
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