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In Laboratorien werden Zebrabärblinge in verschiedenen Becken gehalten, z.B. in Mäusekäfigen Typ II und Glasaquarien. Manchmal werden Aquarien mit Kies oder (synthetischen) Pflanzen ausgestattet, zum Beispiel um Aggression zu vermindern oder Sicherheit zu bieten. Oft sind Becken Teil eines Durchfluss- oder Rezirkulationssystems (Foto 1 und 2). Bei einem Durchflusssystem strömt Wasser auf einer Seite in das Becken und auf der anderen Seite wieder heraus. Rezirkulationssysteme sind Systeme, wo das Wasser, das in die Becken der Zebrabärblinge strömt, über mechanische, biologische und chemische Filter von Abfallstoffen gereinigt wird. Ferner stellen UV-Filter sicher, dass Bakterien usw. getötet werden, bevor das Wasser in die Becken läuft. Das Wasser wird wiederverwendet. Der biologische Filter besteht aus Bakterienkolonien, die unter anderem Ammonium und Ammoniak über Nitrit in Nitrat umwandeln. Insbesondere Ammoniak und Nitrit sind für Fische sehr toxisch. Die Wasserqualität muss deshalb fortwährend überwacht werden. Das Schema unten shows der Abbau von Ammoniak über einige Zwischenschritte bis zum relativ ungefährlichen Nitrat.
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