dist – -Translation – Keybot Dictionary

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  MyCGR: Tools overview  
mycgr_square_dist.x implements the computation of the distances between sequences, by generalizing in the CGR the dinucleotide-relative abundance profile. There are several options for the computation of these distances, in particular one can choose to compute the absolute values or the squares of the differences.
mycgr_square_dist.x implémente le calcul des distances entre séquences, par la généralisation dans la CGR du profil d'abondance relative de dinucléotides. Il existe plusieurs options pour le calcul de ces distances, en particulier on peut choisir de calculer les valeurs absolues ou les carrés des différences. De plus, on peut éventuellement regrouper les distances par espèces. Les résultats peuvent être générés aux formats Graphviz
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A database can also be used to store intermediate results more effectively. The programs mycgr_segment_dist.x and mycgr_tetra_dist.x offer the same functionalities for the CGR on the segment and in the tetrahedron.
, LaTeX. Les calculs sur plusieurs centaines de longues séquences et pour des partitions comportant de nombreuses zones prennent du temps. Pour pallier à ce problème, le programme peut les lancer en parallèle sur plusieurs machines en plaçant tous les fichiers sur un système de fichiers commun (NFS par exemple). Le cluster de l'INRIA Rocquencourt a ainsi été utilisé pour divisé par 15 les temps des longs calculs. Une base de données peut également être utilisée pour stocker plus efficacement les calculs intermédiaires. Les programmes mycgr_segment_dist.x et mycgr_tetra_dist.x offrent les mêmes services pour la CGR sur le segment et dans le tétraèdre.
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A database can also be used to store intermediate results more effectively. The programs mycgr_segment_dist.x and mycgr_tetra_dist.x offer the same functionalities for the CGR on the segment and in the tetrahedron.
, LaTeX. Les calculs sur plusieurs centaines de longues séquences et pour des partitions comportant de nombreuses zones prennent du temps. Pour pallier à ce problème, le programme peut les lancer en parallèle sur plusieurs machines en plaçant tous les fichiers sur un système de fichiers commun (NFS par exemple). Le cluster de l'INRIA Rocquencourt a ainsi été utilisé pour divisé par 15 les temps des longs calculs. Une base de données peut également être utilisée pour stocker plus efficacement les calculs intermédiaires. Les programmes mycgr_segment_dist.x et mycgr_tetra_dist.x offrent les mêmes services pour la CGR sur le segment et dans le tétraèdre.