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Si une infection apparaît chez l'enfant alors que son nombre de GB est bas, on le traite habituellement par perfusion d'antibiotiques à l'hôpital, où on peut le surveiller. Avant de commencer à administrer les antibiotiques, on fait des cultures pour essayer d'identifier l'organisme qui cause l'infection. Il se peut qu'on débute avec des antibiotiques à large spectre avant de connaître les résultats puisque les infections peuvent se propager rapidement. Une fois qu'on connaît la cause de l'infection, il est possible de changer le traitement. Pour la plupart des infections, le traitement aux antibiotiques dure de 7 à 10 jours selon les facteurs suivants :
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