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Ein anderes eindrucksvolles Beispiel ist der Einfluss der Ernährung auf die Epigenetik der Maus während ihrer Entwicklung. Tiere mit einem aktiven Agouti-Gen haben ein gelbes Fell, und eine Neigung zur Fettleibigkeit. Allerdings kann dieses Gen durch DNA-Methylierung abgeschaltet werden. Wenn eine trächtige Agouti-Maus Nahrungszusätze erhält, die die Abspaltung von Methylgruppen bewirken, wie z.B. Folsäure oder Cholin, werden die Agouti-Gene der Nachkommen methyliert, und dadurch inaktiv. Die Nachkommen tragen zwar noch immer das Agouti-Gen, verlieren aber den Agouti-Phänotyp: sie tragen braunes Fell und zeigen keine verstärkte Neigung zur Fettleibigkeit (Abb.3).
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