gene expression regulation – French Translation – Keybot Dictionary
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Study of signal transduction and
gene expression regulation
: Notch pathway, NFkB pathway, PPAR and LXR
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Étude de la transduction des signaux et de la régulation de l’expression génique : voie Notch, voie NFkB, PPAR et LXR
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Functional classification revealed that, among the annotated genes, ~40% are associated with cellular metabolism and transport and the rest of the target genes fall into the category of signal transduction and
gene expression regulation
.
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Chez le F. graminearum, le régulateur de la transcription Tri6, qui intervient dans la régulation des gènes de biosynthèse du métabolite secondaire du désoxynivalénol (DON), est codé par des gènes de la famille de ceux qui codent le tricothécène. Avec son doigt de zinc Cys2His2, la protéine Tri6 peut être considérée comme un régulateur global de la transcription. Ce type de facteur de régulation joue un rôle dans la transmission de divers signaux environnementaux et répond généralement aux demandes du métabolisme cellulaire. Pour étudier la question directement, nous avons cherché les cibles géniques de Tri6 chez le F. graminearum cultivé en milieu riche. L’immunoprécipitation de la chromatine suivie du séquençage à l’aide du système Illumina (ChIP-Seq) a révélé qu’en plus des six gènes de la famille des gènes codant le trichothécène Tri1, Tri3, Tri6, Tri7, Tri12 et Tri14, il existe 192 autres cibles qui pourraient être régulées par Tri6. La classification fonctionnelle montre que parmi les gènes annotés, ~40 % sont associés au métabolisme cellulaire et au transport, et que les autres font partie de la catégorie de transduction des signaux et de régulation de l’expression génique. Les données de ChIP-Seq ont également révélé que c’est pour son propre promoteur que la protéine Tri6 présente le plus d’affinité, ce qui semble indiquer que le gène pourrait faire l’objet d’une autorégulation. Les essais de mobilité électrophorétique (EMSA, pour Electro Mobility Shift Assays) faits avec le promoteur de Tri6 et la protéine Tri6 purifiée ont permis d’identifier un motif de liaison minimal de répétitions GTGA comme séquence consensus. Finalement, le profilage de l’expression du F. graminearum cultivé dans des conditions limitantes en azote ont révélé que 49 des 198 gènes cibles sont régulés de façon différentielle par Tri6. L’identification de nouvelles cibles potentielles et de nouveaux sites de liaison de Tri6 permet de mieux comprendre le rôle de ce régulateur de la transcription dans la croissance et le développement du F.graminearum.