gene ontology – French Translation – Keybot Dictionary

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pisi origin. The remaining unisequences were subjected to gene ontology analysis and their functions were predicted in silico. Eleven of these unisequences (representing 24 clones) shared significant sequence similarities with Arabidopsis genes known to be involved in downy mildew resistance, including the well-characterised genes RPP5, RPP6 and RPP27.
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Nous avons construit une banque d’ADNc de feuilles de pois de grande culture infectées par l’agent du mildiou, Peronospora viciae f. sp. pisi, par une méthode d’hybridation suppressive soustractive (SSH). Notre banque comprend 399 étiquettes de séquences exprimées dont l’assemblage a donné 207 uniséquences. Sur ce total, 6 uniséquences provenaient de Peronospora viciae f. sp. pisi. Nous avons fait une analyse ontologique des autres uniséquences et prédit leurs fonctions in silico : 11 d’entre elles (correspondant à 24 clones) présentaient des similitudes de séquence significatives avec des gènes d’Arabidopsis intervenant dans la résistance au mildiou et notamment les gènes RPP5, RPP6 et RPP27 qui sont bien caractérisés. L’analyse par PCR en temps réel de l’expression de 5 uniséquences a révélé qu’elles étaient toutes régulées à la hausse durant la pathogenèse du mildiou, ce qui laisse supposer que les gènes correspondants remplissent un rôle important dans la réponse de l’hôte infecté par l’agent du mildiou.
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Results: Use of a 44K Agilent chicken genome microarray revealed significant upregulation of many immune-associated genes in Cp-challenged chickens, including galectin 3, IFNAR1, IgY-receptor, TCRγ, granzyme A, and mannose-6-P-R, which were subsequently validated by quantitative PCR assays. Functional annotation of differentially expressed genes was conducted using the High Throughput Gene Ontology Functional Annotation database.
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Contexte : Clostridium perfringens est une bactérie anaérobie à Gram positif dont la croissance excessive dans l’intestin grêle de la volaille cause une entérite nécrotique. On utilisait auparavant des antibiotiques favorisant la croissance pour lutter contre cette maladie chez la volaille, mais cette pratique a récemment été interdite en Europe, où on remarque une augmentation importante de l’incidence de la maladie, menaçant l’industrie de la volaille. Il existe donc, à l’heure actuelle, un besoin urgent de stratégies et de technologies pour lutter contre cette maladie. Dans l’élaboration de substituts aux antibiotiques utilisés précédemment, il est important de bien comprendre la réponse immunitaire de l’hôte à l’infection à Clostridium perfringens. Or, les connaissances en la matière sont encore insuffisantes. Nous avons donc entrepris d’examiner les profils d’expression génique dans la rate, un tissu important sur le plan immunologique, en vue d’identifier les facteurs jouant un rôle dans l’immunité à l’égard de l’entérite nécrotique et pouvant servir de cibles thérapeutiques. Résultats. L’utilisation d’une puce Agilent de 44k, contenant de l’ADN du génome du poulet, a révélé une importante régulation à la hausse de plusieurs gènes associés à l’immunité chez des poulets exposés au C. perfringens, dont les suivants : galectin 3, IFNAR1, récepteur IgY, TCRγ, granzyme A et mannose-6-P-R; ces gènes ont ensuite été validés par PCR quantitative. L’évaluation fonctionnelle des gènes exprimés de façon différentielle a été réalisée au moyen de la base de données de la High Throughput Gene Ontology Functional Annotation. Les poulets recevant des médicaments et ceux n’en recevant pas avaient des profils d’évaluation similaires, l’activité cellulaire et la régulation étant les processus biologiques les plus dominants après l’infection par le C. perfringens. Conclusions. On a observé un éventail complexe de réponses de l’hôte à l’exposition au C. perfringens et au développement de l’entérite nécrotique. Même si l’effet des antibiotiques alimentaires semble moins important que le processus morbide, ces deux éléments ont eu un impact considérable sur la réponse de l’hôte. Les marqueurs déjà identifiés dans des maladies intestinales inflammatoires chez d’autres espèces, dont l’humain, et les indicateurs de production accrue d’anticorps semblent jouer un rôle dans la réponse du poulet à l’exposition au C. perfringens. L’importance des médiateurs de l’immunité identif
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Results: Use of a 44K Agilent chicken genome microarray revealed significant upregulation of many immune-associated genes in Cp-challenged chickens, including galectin 3, IFNAR1, IgY-receptor, TCRγ, granzyme A, and mannose-6-P-R, which were subsequently validated by quantitative PCR assays. Functional annotation of differentially expressed genes was conducted using the High Throughput Gene Ontology Functional Annotation database.
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Contexte : Clostridium perfringens est une bactérie anaérobie à Gram positif dont la croissance excessive dans l’intestin grêle de la volaille cause une entérite nécrotique. On utilisait auparavant des antibiotiques favorisant la croissance pour lutter contre cette maladie chez la volaille, mais cette pratique a récemment été interdite en Europe, où on remarque une augmentation importante de l’incidence de la maladie, menaçant l’industrie de la volaille. Il existe donc, à l’heure actuelle, un besoin urgent de stratégies et de technologies pour lutter contre cette maladie. Dans l’élaboration de substituts aux antibiotiques utilisés précédemment, il est important de bien comprendre la réponse immunitaire de l’hôte à l’infection à Clostridium perfringens. Or, les connaissances en la matière sont encore insuffisantes. Nous avons donc entrepris d’examiner les profils d’expression génique dans la rate, un tissu important sur le plan immunologique, en vue d’identifier les facteurs jouant un rôle dans l’immunité à l’égard de l’entérite nécrotique et pouvant servir de cibles thérapeutiques. Résultats. L’utilisation d’une puce Agilent de 44k, contenant de l’ADN du génome du poulet, a révélé une importante régulation à la hausse de plusieurs gènes associés à l’immunité chez des poulets exposés au C. perfringens, dont les suivants : galectin 3, IFNAR1, récepteur IgY, TCRγ, granzyme A et mannose-6-P-R; ces gènes ont ensuite été validés par PCR quantitative. L’évaluation fonctionnelle des gènes exprimés de façon différentielle a été réalisée au moyen de la base de données de la High Throughput Gene Ontology Functional Annotation. Les poulets recevant des médicaments et ceux n’en recevant pas avaient des profils d’évaluation similaires, l’activité cellulaire et la régulation étant les processus biologiques les plus dominants après l’infection par le C. perfringens. Conclusions. On a observé un éventail complexe de réponses de l’hôte à l’exposition au C. perfringens et au développement de l’entérite nécrotique. Même si l’effet des antibiotiques alimentaires semble moins important que le processus morbide, ces deux éléments ont eu un impact considérable sur la réponse de l’hôte. Les marqueurs déjà identifiés dans des maladies intestinales inflammatoires chez d’autres espèces, dont l’humain, et les indicateurs de production accrue d’anticorps semblent jouer un rôle dans la réponse du poulet à l’exposition au C. perfringens. L’importance des médiateurs de l’immunité identif