helix loop – French Translation – Keybot Dictionary

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Conservation of Three-Dimensional Helix-Loop-Helix Structure through the Vertebrate Lineage Reopens the Cold Case of Gonadotropin-Releasing Hormone-Associated Peptide
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Lire la suite de International Symposium of Fisheries Science du 22 au 24 septembre 2017 à Tokyo (Japon)
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Figure 5. Alveolar Soft Part Sarcoma (ASPS) Translocation. The translocation between chromosome 17 (blue) and X (orange) characteristic of ASPS is seen in panel A. In the exonic gene diagrams (B), the TFE3 gene (Xp11.2; orange) contributes either exons 3-8 or 4-8. Abbreviations: UT, untranslated region; AD, activation domain; bHLH, basic helix-loop-helix domain; UBX, UBX homology domain; LZ, leucine zipper domain.
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Figure 5. Translocation du sarcome alvéolaire des tissus mous. La translocation entre le chromosome 17 (bleu) et le chromosome X (orange), caractéristique du sarcome alvéolaire, est présentée dans le panneau A. Dans le diagramme des exons (B), les exons du gène TFE3 impliqués dans la translocation (exons 3-8, ou4-8). Abréviations: UT: région non traduite, AD: domaine d’activation, bHLH: domaine basique hélice-boucle-hélice ; UBX : domaine d’homologie UBX ; LZ : fermeture éclair leucine.
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PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR3 (PIF3) is a key basic helix-loop-helix transcription factor of Arabidopsis thaliana that negatively regulates light responses, repressing chlorophyll biosynthesis, photosynthesis, and photomorphogenesis in the dark. However, the mechanism for the PIF3-mediated transcription regulation remains largely unknown. In this study, we found that the REDUCED POTASSIUM DEPENDENCY3/HISTONE DEACETYLASE1-type histone deacetylase HDA15 directly interacted with PIF3 in vivo and in vitro. Genome-wide transcriptome analysis revealed that HDA15 acts mainly as a transcriptional repressor and negatively regulates chlorophyll biosynthesis and photosynthesis gene expression in etiolated seedlings. HDA15 and PIF3 cotarget to the genes involved in chlorophyll biosynthesis and photosynthesis in the dark and repress gene expression by decreasing the acetylation levels and RNA Polymerase II–associated transcription. The binding of HDA15 to the target genes depends on the presence of PIF3. In addition, PIF3 and HDA15 are dissociated from the target genes upon exposure to red light. Taken together, our results indicate that PIF3 associates with HDA15 to repress chlorophyll biosynthetic and photosynthetic genes in etiolated seedlings.
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Chez Arabidopsis thaliana, le facteur PIF3 (PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 3) est un facteur de transcription hélice-boucle-hélice de base essentiel qui exerce une action régulatrice inhibitrice sur les photoréactions en réprimant la biosynthèse de la chlorophylle, la photosynthèse et la photomorphogenèse à l’obscurité. Or, le mécanisme de la régulation de la transcription relayée par le facteur PIF3 demeure très mal connu. Dans les travaux présentés ici, nous avons constaté que l’histone désacétylase HDA15 (du type REDUCED POTASSIUM DEPENDENCY3/HISTONE DEACETYLASE1) interagit directement avec le facteur PIF3 in vivo et in vitro. L’analyse du transcriptome pangénomique a révélé que la HDA15 agit essentiellement comme un répresseur transcriptionnel et exerce une action inhibitrice sur l’expression des gènes de la biosynthèse de la chlorophylle et de la photosynthèse dans les semis étiolés. La HDA15 et le facteur PIF3 ciblent conjointement les gènes intervenant dans la biosynthèse de la chlorophylle et dans la photosynthèse à l’obscurité et répriment l’expression génique en abaissant le degré d’acétylation et la transcription associée à l’ARN-polymérase II. La fixation de la HDA15 sur les gènes cibles dépend de la présence du facteur PIF3. En outre, à l’exposition à la lumière rouge, le facteur PIF3 et la HDA15 se dissocient des gènes cibles. Dans l’ensemble, nos résultats indiquent que le facteur PIF3 s’associe à la HDA15 pour réprimer les gènes de la biosynthèse de la chlorophylle et de la photosynthèse dans les semis étiolés.
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Basic helix-loop-helix (bHLH) proteins constitute a large family of transcriptional regulators in plants. Although they have been shown to play important roles in a wide variety of developmental processes, relatively few have been functionally characterized. Here we describe the map-based cloning of the Lotus japonicus ROOTHAIRLESS1 (LjRHL1) locus. Deleterious mutations in this locus prevent root hair development, which also aborts root hair-dependent colonization of the host root by nitrogen fixing bacteria. We show that the LjRHL1 gene encodes a presumed basic helix-loop-helix transcription factor that functions in a non-redundant manner to control root hair development in L. japonicus. Homology search and cross-species complementation experiments defined three members of the Arabidopsis thaliana bHLH protein family, At2g24260, At4g30980, and At5g58010, as functionally equivalent to LjRHL1. Curiously, At2g24260 and At4g30980 mRNA species accumulate independently from the known positive regulators of root hair cell fate, while all three genes act in a partially redundant manner to regulate root hair development in Arabidopsis.
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Les protéines à motif basique hélice-boucle-hélice forment une grande famille de facteurs de régulation de la transcription chez les végétaux. Bien que l’on sache que ces protéines jouent un rôle important dans différents processus de développement, peu d’entre elles ont été caractérisées sur le plan fonctionnel. Nous décrivons, ici, le clonage positionnel du locus ROOTHAIRLESS1 (LjRHL1) de Lotus japonicus. Les mutations délétères dans ce locus empêchent le développement des poils absorbants, ce qui empêche également la colonisation des poils absorbants de l’hôte par des bactéries fixatrices d’azote. Avec cette étude, nous montrons que le gène LjRHL1 code un présumé facteur de transcription à motif basique hélice-boucle-hélice dont le fonctionnement non redondant permet la régulation du développement des poils absorbants chez L. japonicus. La recherche d’homologie et les expériences de complémentation interespèces ont permis de déterminer que trois membres de la famille des protéines à motif basique hélice-boucle-hélice d’Arabidopsis thaliana (At2g24260, At4g30980 et At5g58010) étaient équivalents à la protéine LjRHL1 sur le plan fonctionnel. Curieusement, l’ARNm des protéines At2g24260 et At4g30980 s’accumule indépendamment des régulateurs positifs connus du devenir des cellules des poils absorbants, et les trois gènes agissent d’une manière partiellement redondante dans la régulation du développement des poils absorbants chez Arabidopsis.
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PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR3 (PIF3) is a key basic helix-loop-helix transcription factor of Arabidopsis thaliana that negatively regulates light responses, repressing chlorophyll biosynthesis, photosynthesis, and photomorphogenesis in the dark. However, the mechanism for the PIF3-mediated transcription regulation remains largely unknown. In this study, we found that the REDUCED POTASSIUM DEPENDENCY3/HISTONE DEACETYLASE1-type histone deacetylase HDA15 directly interacted with PIF3 in vivo and in vitro. Genome-wide transcriptome analysis revealed that HDA15 acts mainly as a transcriptional repressor and negatively regulates chlorophyll biosynthesis and photosynthesis gene expression in etiolated seedlings. HDA15 and PIF3 cotarget to the genes involved in chlorophyll biosynthesis and photosynthesis in the dark and repress gene expression by decreasing the acetylation levels and RNA Polymerase II–associated transcription. The binding of HDA15 to the target genes depends on the presence of PIF3. In addition, PIF3 and HDA15 are dissociated from the target genes upon exposure to red light. Taken together, our results indicate that PIF3 associates with HDA15 to repress chlorophyll biosynthetic and photosynthetic genes in etiolated seedlings.
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Chez Arabidopsis thaliana, le facteur PIF3 (PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 3) est un facteur de transcription hélice-boucle-hélice de base essentiel qui exerce une action régulatrice inhibitrice sur les photoréactions en réprimant la biosynthèse de la chlorophylle, la photosynthèse et la photomorphogenèse à l’obscurité. Or, le mécanisme de la régulation de la transcription relayée par le facteur PIF3 demeure très mal connu. Dans les travaux présentés ici, nous avons constaté que l’histone désacétylase HDA15 (du type REDUCED POTASSIUM DEPENDENCY3/HISTONE DEACETYLASE1) interagit directement avec le facteur PIF3 in vivo et in vitro. L’analyse du transcriptome pangénomique a révélé que la HDA15 agit essentiellement comme un répresseur transcriptionnel et exerce une action inhibitrice sur l’expression des gènes de la biosynthèse de la chlorophylle et de la photosynthèse dans les semis étiolés. La HDA15 et le facteur PIF3 ciblent conjointement les gènes intervenant dans la biosynthèse de la chlorophylle et dans la photosynthèse à l’obscurité et répriment l’expression génique en abaissant le degré d’acétylation et la transcription associée à l’ARN-polymérase II. La fixation de la HDA15 sur les gènes cibles dépend de la présence du facteur PIF3. En outre, à l’exposition à la lumière rouge, le facteur PIF3 et la HDA15 se dissocient des gènes cibles. Dans l’ensemble, nos résultats indiquent que le facteur PIF3 s’associe à la HDA15 pour réprimer les gènes de la biosynthèse de la chlorophylle et de la photosynthèse dans les semis étiolés.