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Such studies cannot always be completed, as however comprehensive the sample taken, species are often represented by only one or two specimens, which is not always sufficient to determine their novelty. Unfortunately, a lack of expertise is often the ultimate handicap; for some rare groups there is simply no specialist.
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Chaque année, 1600 à 1700 nouvelles espèces marines sont découvertes, et s'ajoutent aux quelques 235 000 déjà répertoriées. La moitié d'entre elles sont représentées par des mollusques et des crustacés. Pourtant, la majeure partie des programmes de recherche et des initiatives de conservation concernent la grande faune des océans (tortues, mammifères marins, poissons, coraux constructeurs de récifs...), qui ne représentent que 8 % de la biodiversité marine... Ce déséquilibre s'explique, d'une part, par le « charisme » des grands animaux. Il est plus facile d'intéresser le public et de lever des fonds pour la sauvegarde des tortues marines ou des cétacés que pour l'étude des microgastéropodes benthiques. La mégafaune, d'autre part, est plus facile à étudier que la microfaune, surtout lorsqu'on s'intéresse à des régions aussi riches en biodiversité que le Triangle de Corail. En effet, dans les écosystèmes complexes, les espèces sont généralement petites et rares. En conséquence, le nombre d'échantillons collectés au cours d'une mission d'exploration est habituellement faramineux, ce qui implique un énorme travail de tri et, par la suite, d'analyse des données par les taxonomistes. Des analyses qui ne peuvent pas toujours être menées à leur terme car quelle que soit l'intensité de l'échantillonnage, il arrive souvent que des espèces ne soient représentées que par un ou deux spécimens, ce qui ne suffit pas systématiquement à déterminer leur nouveauté. Enfin, malheureusement, le manque d'expertise constitue parfois un ultime handicap : pour certains groupes rares, il n'existe tout simplement pas de spécialiste. Dans ce cas, les spécimens sont intégrés aux collections des muséums en attendant que quelqu'un, un jour, vienne les étudier.
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