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The objective of this work was to evaluate the capacity of pyrolysis metastable atom bombardment time-of-flight mass spectrometry (Py-MAB-TOF-MS) to provide replicable analysis of soil lipids, compared to a routine gas chromatography-flame ionization detection (GC-FID) method.
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Les profils des biomarqueurs lipidiques constituent des outils puissants pour évaluer la structure des communautés microbiennes du sol, mais il faudra encore beaucoup de travail de laboratoire et d’analyse de données pour parvenir à établir des profils d’acides gras phospholipidiques et d’autres biomarqueurs courants. La pyro-spectrométrie de masse (Py-MS) est une méthode rapide et sensible qui permet d’obtenir une « empreinte » des lipides du sol qui pourrait suffire à caractériser les lipides de différents sites. Nos travaux visaient à évaluer la capacité de la pyro-spectrométrie de masse à temps de vol avec ionisation par bombardement d’atomes métastables (Py-MAB-TOF-MS) à fournir des résultats répétables sur les lipides du sol, comparativement à la chromatographie en phase gazeuse avec détecteur à ionisation de flamme (GC-FID). Des échantillons de sol ont été prélevés de six champs de culture de soja, de maïs et d’asperges. Les lipides extraits à l’aide d’un solvant 1:2 chloroforme:méthanol ont été analysés par Py-MAB-TOF-MS ou transestérifiés en acides gras, puis analysés par GC-FID. Les deux méthodes étaient complémentaires, mais distinctes : les empreintes lipidiques obtenues par Py-MAB-TOF-MS comprenaient des lipides extractibles d’origine microbienne, animale et végétale ainsi que des matières organiques non vivantes, tandis que les profils d’acides gras représentaient généralement des lipides d’origine bactérienne et fongique. Nous en concluons que les empreintes des lipides du sol obtenues par Py-MAB-TOF-MS présentent une plus grande variabilité que les profils obtenus par GC-FID, parce qu’ils comprennent un groupe plus étendu de lipides extractibles. Il faudra d’autres études pour déterminer, dans les spectres de Py-MAB-TOF-MS, les masses moléculaires des fragments qui pourraient identifier les lipides d’origine microbienne dans le sol.
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The objective of this work was to evaluate the capacity of pyrolysis metastable atom bombardment time-of-flight mass spectrometry (Py-MAB-TOF-MS) to provide replicable analysis of soil lipids, compared to a routine gas chromatography-flame ionization detection (GC-FID) method.
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Les profils des biomarqueurs lipidiques constituent des outils puissants pour évaluer la structure des communautés microbiennes du sol, mais il faudra encore beaucoup de travail de laboratoire et d’analyse de données pour parvenir à établir des profils d’acides gras phospholipidiques et d’autres biomarqueurs courants. La pyro-spectrométrie de masse (Py-MS) est une méthode rapide et sensible qui permet d’obtenir une « empreinte » des lipides du sol qui pourrait suffire à caractériser les lipides de différents sites. Nos travaux visaient à évaluer la capacité de la pyro-spectrométrie de masse à temps de vol avec ionisation par bombardement d’atomes métastables (Py-MAB-TOF-MS) à fournir des résultats répétables sur les lipides du sol, comparativement à la chromatographie en phase gazeuse avec détecteur à ionisation de flamme (GC-FID). Des échantillons de sol ont été prélevés de six champs de culture de soja, de maïs et d’asperges. Les lipides extraits à l’aide d’un solvant 1:2 chloroforme:méthanol ont été analysés par Py-MAB-TOF-MS ou transestérifiés en acides gras, puis analysés par GC-FID. Les deux méthodes étaient complémentaires, mais distinctes : les empreintes lipidiques obtenues par Py-MAB-TOF-MS comprenaient des lipides extractibles d’origine microbienne, animale et végétale ainsi que des matières organiques non vivantes, tandis que les profils d’acides gras représentaient généralement des lipides d’origine bactérienne et fongique. Nous en concluons que les empreintes des lipides du sol obtenues par Py-MAB-TOF-MS présentent une plus grande variabilité que les profils obtenus par GC-FID, parce qu’ils comprennent un groupe plus étendu de lipides extractibles. Il faudra d’autres études pour déterminer, dans les spectres de Py-MAB-TOF-MS, les masses moléculaires des fragments qui pourraient identifier les lipides d’origine microbienne dans le sol.
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Les profils des biomarqueurs lipidiques constituent des outils puissants pour évaluer la structure des communautés microbiennes du sol, mais il faudra encore beaucoup de travail de laboratoire et d’analyse de données pour parvenir à établir des profils d’acides gras phospholipidiques et d’autres biomarqueurs courants. La pyro-spectrométrie de masse (Py-MS) est une méthode rapide et sensible qui permet d’obtenir une « empreinte » des lipides du sol qui pourrait suffire à caractériser les lipides de différents sites. Nos travaux visaient à évaluer la capacité de la pyro-spectrométrie de masse à temps de vol avec ionisation par bombardement d’atomes métastables (Py-MAB-TOF-MS) à fournir des résultats répétables sur les lipides du sol, comparativement à la chromatographie en phase gazeuse avec détecteur à ionisation de flamme (GC-FID). Des échantillons de sol ont été prélevés de six champs de culture de soja, de maïs et d’asperges. Les lipides extraits à l’aide d’un solvant 1:2 chloroforme:méthanol ont été analysés par Py-MAB-TOF-MS ou transestérifiés en acides gras, puis analysés par GC-FID. Les deux méthodes étaient complémentaires, mais distinctes : les empreintes lipidiques obtenues par Py-MAB-TOF-MS comprenaient des lipides extractibles d’origine microbienne, animale et végétale ainsi que des matières organiques non vivantes, tandis que les profils d’acides gras représentaient généralement des lipides d’origine bactérienne et fongique. Nous en concluons que les empreintes des lipides du sol obtenues par Py-MAB-TOF-MS présentent une plus grande variabilité que les profils obtenus par GC-FID, parce qu’ils comprennent un groupe plus étendu de lipides extractibles. Il faudra d’autres études pour déterminer, dans les spectres de Py-MAB-TOF-MS, les masses moléculaires des fragments qui pourraient identifier les lipides d’origine microbienne dans le sol.
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