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Pour la composante océanique, le système utilise le modèle glace-océan (MoGSL) qui inclut un modèle de circulation océanique 3D en tenant compte des marées et des apports d'eau douce des rivières aux frontières. Le domaine de calcul du MoGSL consiste en une grille de 150 par 236 points dans l'horizontale, s'étendant du détroit de Cabot à la ville de Québec et au fjord du Saguenay près de Tadoussac. Un modèle hydrologique à une dimension est utilisé pour le tronçon de Montréal à Québec pour absorber les marées à Québec. La résolution horizontale est de 5 km sur une projection Mercator tournée. Le domaine océanique est discrétisé en couches verticales avec résolution uniforme de 5 m jusqu'à 300 m puis de 10m en deçà de 300 m de profondeur. Les couches de surface et de fond sont ajustées au niveau de l'eau et à la profondeur du milieu respectivement. Les conditions aux frontières pour l'apport des rivières, pour la température et la salinité de l'eau sont prises de données climatologiques et les marées sont prescrites comme dans Saucier et al. (2003).
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