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Show text Show cached source Open source URL	2010 AgriStability Program Price List - Nova Scotia (MS-Excel Version, 93 KB)
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The antihistamine diphe...

The time to dissipate 50% (DT50) of 14C-diphenhydramine residues at 30 °C ranged from 88 ± 28 days in the clay loam to 335 ± 145 days in the loam soil. Mineralization of 14C was insignificant, and diphenhydramine-N-oxide was the only detected extractable transformation product elucidated by radioisotope and HPLC-MS methods.

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Le composé antihistaminique diphénhydramine, largement utilisé, est présent dans des biosolides municipaux et est détecté dans des eaux de ruissellement provenant de terres agricoles fertilisées au moyen de ces biosolides. Pour la présente étude, nous avons déterminé la cinétique et les principales voies d’élimination de la diphénhydramine dans un sol constitué de loam, de loam sableux ou de loam argileux au moyen d’incubations en laboratoire. Le temps mis pour dissiper 50 % (TD50) des résidus de 14C-diphénhydramine à 30 °C allait de 88 ± 28 jours pour le loam argileux à 335 ± 145 jours pour le loam. La minéralisation de 14C était insignifiante, et le N oxyde de diphénhydramine était le seul produit de transformation extractible détecté, déterminé au moyen de méthodes radioisotopiques et de CLHP/SM. Il n’y avait aucun effet significatif des biosolides municipaux sur la cinétique et les voies d’élimination. Globalement, la diphénhydramine est assez persistante dans les sols, et la formation de résidus liés au sol et non extractibles est le principal mécanisme d’élimination de la diphénhydramine.

Assessment of Regenerat...

Five different varieties of Japanese plum ('Shiro', 'Early Golden', 'Gladstone', 'Red Heart' and 'Bruce'), four different basal salt mixtures (QL, WPM, B5 and MS), light regimes and TDZ pretreatments were evaluated to optimize adventitious shoot regeneration.

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Pour augmenter les taux de transformation chez les végétaux, il est très important d’obtenir des taux de régénération élevés et d’optimiser les facteurs d’expression transitoire. Nous avons mis au point un protocole de régénération efficace et effectué des expériences d’expression transitoire pour obtenir les données nécessaires à l’amélioration du système de transformation du prunier japonais (Prunus salicina Lindl.) par Agrobacterium tumefaciens. Nous avons évalué cinq variétés différentes de prunier japonais (‘Shiro’, ‘Early Golden’, ‘Gladstone’, ‘Red Heart’ et ‘Bruce’), quatre mélanges de sels de base différents (QL, WPM, B5 et MS), quatre programmes d’éclairage et quatre prétraitements au TDZ dans le but d’optimiser la régénération de pousses adventices. La capacité de régénération variait beaucoup selon la variété utilisée. La composition en sels de base avait un effet significatif sur la fréquence de régénération. Nous avons obtenu les meilleures fréquences de régénération avec la variété ‘Shiro’ (56,4 %) sur mélange QL et avec la variété ‘Early Golden’ (42,8 %) sur mélange B5. Nous avons ensuite effectué des expériences d’expression transitoire à l’aide de trois souches de Agrobacterium tumefaciens, LBA4404, EHA105 et GB3101, contenant le vecteur binaire pCAMBIA2301. Nous avons observé des différences significatives selon la souche de Agrobacterium utilisée. Les souches LBA4404 et EHA105 étaient beaucoup plus efficaces que la souche GV3101, et la présence d’acétosyringone dans le milieu de coculture se traduisait par une augmentation de l’expression du gène GUS.

Functions of

This study aimed to determine the role of the antifungal compound(s) in the cell-free filtrate of B. amyloliquefaciens C06 by an approach combining a DNA-based suppression subtractive hybridization (SSH) method with MALDI-TOF-MS analysis.

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Des travaux antérieurs ont révélé que Bacillus amyloliquefaciens C06 est efficace contre la pourriture brune des fruits à noyau causée par le champignon Monilinia fructicola. Dans des épreuves in vitro, un filtrat acellulaire de B. amyloliquefaciens C06 a inhibé dans une mesure significative la croissance du mycélium et la germination des conidies du champignon pathogène. Nous avons réalisé l’étude présentée ici pour déterminer le rôle des composés antifongiques du filtrat acellulaire de B. amyloliquefaciens C06 par une méthode combinant l’hybridation suppressive soustractive d’ADN avec l’analyse par MALDI-TOF-MS. Nous avons constaté que B. amyloliquefaciens C06 possède 2 gènes, soit le gène bmyC et le gène fenD, qui interviennent dans la biosynthèse de 2 lipopeptides, la bacillomycine D, de la famille des iturines, et la fengycine, de la famille des fengycines. Pour savoir comment ces 2 lipopeptides interviennent dans l’inhibition de M. fructicola, des mutants de B. amyloliquefaciens C06 ne produisant pas de bacillomycine D ou de fengycine, ou ne produisant ni l’un ni l’autre de ces 2 lipopeptides, ont été construits et évalués in vitro avec le type sauvage de B. amyloliquefaciens C06. Nos résultats indiquent que la bacillomycine D et la fengycine ont contribué conjointement à l’inhibition de la germination des conidies de M. fructicola, et que la fengycine a joué un rôle déterminant dans l’inhibition de la croissance mycélienne de ce champignon pathogène.

Secondary metabolites f...

The extracts of a selection of 150 foliar fungal endophytes isolated from Picea rubens (red spruce) needles were screened by LC-MS and assayed for toxicity. Three of these strains that were toxic to the forest pest Choristoneura fumiferana (eastern spruce budworm) in dietary bioassays were selected for further study.

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Des extraits d’une sélection de 150 endophytes fongiques foliaires isolés à partir d’aiguilles de Picea rubens (épinette rouge) ont été filtrés par CL - SM et soumis à des essais de toxicité. On a sélectionné pour des études supplémentaires trois de ces souches qui étaient toxiques pour le ravageur forestier Choristoneura fumiferana (tordeuse des bougeons de l’épinette) selon des essais biologiques alimentaires. On a analysé des extraits de cultures de ces souches par CL - spectroscopie RMN, et les principaux métabolites ont été isolés par CL - SM - EPS ou par CCMP/chromatographie sur colonne et caractérisés. On a élucidé leur structure par des analyses spectroscopiques, notamment la RMN 2D, la SMHR et par comparaison avec les données de la documentation. Les composés 1 et 5 - 7 étaient inconnus à ce jour, alors que les composés 2 et 3 sont des produits naturels décrits pour la première fois. On a rapporté pour la première fois que le composé 4 est un métabolite fongique et on a identifié les composés 8 - 9, qui sont des métabolites fongiques de genres connus. Le filtrage des endophytes fongiques de Picea rubens a donné des extraits qui présentaient des signes de toxicité pour le ravageur forestier Choristoneura fumiferana selon des essais biologiques alimentaires. L’isolation des principaux métabolites de trois de ces souches a permis la découverte de quatre produits naturels, les composés 1 et 5 - 7.

Simultaneous isolation ...

The results showed that our method was superior to the other methods, based on 2-DE patterns. We also demonstrated that our protocol is compatible with proteomic analysis, as 10 out of 14 selected proteins isolated by the method were identified by MALDI-TOF-MS/MS.

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Nous décrivons, ici, une méthode d’extraction simultanée des protéines et des acides nucléiques des tissus de Medicago truncatula. Nous avons modifié la méthode au trizol et mis au point une méthode simple et efficace pour extraire simultanément les protéines et les acides nucléiques d’un même échantillon. Nous avons confirmé que notre méthode ne nuit ni à la qualité ni à la quantité de l’ADN et de l’ARN isolés. Nous avons aussi utilisé l’électrophorèse bidimensionnelle (2-DE) pour comparer les protéines extraites des feuilles, de la tige et des racines de M. truncatula avec cette nouvelle méthode aux protéines obtenues avec deux autres méthodes courantes : extraction au phénol, suivie de la précipitation au méthanol et à l’acétate d’ammonium ainsi que précipitation à l’acide trichloracétique et à l’acétone. Les profils d’électrophorèse bidimensionnelle montrent que notre méthode est supérieure aux deux autres. De plus, notre protocole permet l’analyse protéomique, puisque 10 des 14 protéines isolées par notre méthode ont pu être identifiées par MALDI-TOF-MS/MS. Le protocole que nous décrivons peut être jumelé aux protocoles de préparation d’échantillons en vue d’études de protéomique, de transcriptomique et de génomique.

Identification of Pheny...

The present work describes a liquid chromatography-electrospray ionization mass spectrometry (LC-ESI-MS) method for rapid identification of phenylethanoid glycosides in plant extract from Plantago asiatica L. By using a binary mobile phase system consisting of 0.2% acetic acid and acetonitrile under gradient conditions, a good separation was achieved on a reversed-phase C18 column.

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Le présent article décrit une méthode de chromatographie en phase liquide et de spectrométrie de masse avec ionisation par électronébulisation (CPL ESI SM) qui permet l’identification rapide des glycosides de phényléthanoïdes dans les extraits végétaux de Plantago asiatica L. au moyen d’un système contenant une phase mobile binaire comprenant un gradiant d’acétonitrile et d’acide acétique à 0,2 %. Nous avons obtenu une bonne séparation sur une colonne C18 à phase inversée. Les ions [M-H]-, les masses moléculaires et les ions fragments des glycosides de phényléthanoïdes ont été obtenus sous forme d’ions négatifs à l’aide de la CPL ESI SM. L’identification des glycosides de phényléthanoïdes (pics 1 3) dans l’extrait de P. asiatica L. a été fondée sur la correspondance des temps de rétention, la détection des ions moléculaires et les ions fragments obtenus dans les expériences de dissociation induite par collision par rapport à ceux des étalons et des données trouvées dans la littérature.

Separation and identifi...

N-heterocyclics were separated from a biooil, generated by the pyrolysis of chicken manures by column chromatography over neutral alumina and silica, and identified by Pyrolysis Field Ionization Mass Spectrometry (Py-FIMS) and Electrospray Ionization Mass Spectrometry (ESI-MS).

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Nous avons séparé par chromatographie sur colonne d’alumine neutre et de silice les composés N‑hétérocycliques d’une biohuile obtenue par la pyrolyse de fumier de poulet et les avons identifiés par pyro-spectrométrie de masse à ionisation de champ (Py‑FIMS) et spectrométrie de masse avec ionisation electrospray (ESI‑MS). Nous avons confirmé l’identité des structures chimiques dont la présence était indiquée par ESI‑MS en comparant les spectres de masse de dissociation induite par collision des inconnus et ceux d’étalons. Nous avons identifié les sept structures basiques suivantes : pyrazine, benzoquinoline, carbazole, phénylpyridine, indole, pyrazole et pyridine. Les hydrogènes disponibles liés aux carbones et azotes du cycle des sept composés N‑hétérocycliques étaient de plus en plus substitués par des groupements alkyle, principalement des groupements méthylène (m/z 14) pour donner des composés N‑hétérocycliques mono‑, di‑ et tri‑méthylés. Dans certains cas, les substituants étaient des groupements alkyle à plus longue chaîne, comme des groupements éthyle, propyle et jusqu’à heptyle.

Phosphoproteome profile...

Using a combination of strong cation exchange (SCX) and immobilized metal affinity chromatography (IMAC) followed by LC-MS, we identified 2902 putative phosphopeptides with homologous matches to 1496 different proteins.

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Nous présentons ici les résultats d’une analyse protéomique à haut débit des phosphopeptides du Fusarium graminearum, souche DAOM 233423, cultivé in vitro dans un milieu sans limitation nutritionnelle. En utilisant une combinaison de chromatographie d’échange de cations forts et de chromatographie d’affinité sur ions métalliques immobilisés suivie de CPL-SM, nous avons identifié 2902 phosphopeptides putatifs présentant une homologie avec 1496 protéines. L’annotation fonctionnelle de la série de protéines a révélé que les phosphopeptides issus de protéines nucléaires jouant un rôle dans la liaison à l’ATP étaient les plus abondants. Il semblerait que les sites de phosphorylation des phosphoprotéines bien caractérisées représentant différentes fonctions biologiques soient conservés chez le F. graminearum : la séquence des trois phosphopeptides issus de phosphoprotéines connues (facteur d’élongation 1β, protéines ribosomiques acides et glycogène synthase) a révélé la conservation du site de phosphorylation.

Identification of Pheny...

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Separation and identifi...

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Separation and quantifi...

The result showed that activated carbon adsorption could remove the most salt impurities, and gel column chromatography could give the separation of the two kinds of oligosaccharides. ESI-MS, 13C-NMR revealed that the molecular weight (Mw) of two oligosaccharides were 630 and 936, which were identified as neoagarotetraose and neoagarohexaose respectively.

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Dans la présente étude, l’hydrolyse enzymatique a permis d’obtenir des oligosaccharides de l’agar. Nous avons extrait ces oligosaccharides au moyen d’une séparation par adsorption sur charbon activé, puis les avons purifiés davantage par chromatographie sur gel. Nos résultats indiquent que l’adsorption sur charbon activé peut éliminer la majorité des impuretés salines et que la chromatographie sur colonne de gel permet de séparer les deux types d’oligosaccharides obtenus. L’ESI-MS et la RMN du 13C révèlent que les masses moléculaires des deux oligosaccharides sont de 630 et de 936. Ces oligosaccharides ont été identifiés comme étant respectivement du néoagarotétraose et du néoagarohexaose.

Structure characterizat...

Methylation and GC-MS analysis indicated that 60P was mainly composed of three types of sugar residues: 4-Xylp (27.8%), 2,4-Xylp (26.0%) and T-GlcpA (22.5%); small amount of 4-GalpA, 4-Glcp, T-Araf, T-Arap and 4, 6-GalpA were also detected with comparable molar ratio.

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La structure d’un hétéropolysaccharide (60P) de masse moléculaire élevée, isolé de Artemisia sphaerocephala Krasch, a été déterminée par analyse de méthylation et par spectroscopie de RMN du 2D. 60P (MM de 551 kDa) a été isolé de graines de A. sphaerocephala Krasch par extraction à l’eau chaude et précipitation au sulfate d’ammonium. La méthylation et l’analyse par CG/SM ont montré que 60P était principalement composé de trois types de résidus de sucres : 4-Xylp (27,8 %), 2,4-Xylp (26,0 %) et T-GlcpA (22,5 %). De petites quantités de 4-GalpA, 4-Glcp, T-Araf, T-Arap et 4, 6-GalpA ont aussi été détectées dans des rapports molaires comparables. En se basant sur les résultats sur la composition en monosaccharide, de l’analyse de méthylation et de spectroscopie de RMN, on propose la structure représentée ci-après : [image non incluse].

Rampitsch, Christof, Ph...

Show text Show cached source Open source URL	"Identifying targets of NADPH oxidase‐mediated redox signalling in Fusarium graminearum using an LC‐MS approach.", 7th Canadian Workshop on Fusarium Head Blight (CWFHB) / Colloque canadien sur la fusariose, Delta Winnipeg Hotel, Winnipeg, MB, Canada, November 27-30, 2011, pp. 97.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	Joshi, M., Subramaniam, R., et Rampitsch, C. (2011). « Identifying targets of NADPH oxidase‐mediated redox signalling in Fusarium graminearum using an LC‐MS approach. », 7th Canadian Workshop on Fusarium Head Blight (CWFHB) / Colloque canadien sur la fusariose, Delta Winnipeg Hotel, Winnipeg, MB, Canada, November 27-30, 2011, p. 97.

Blackwell, Barbara, Ph....

Show text Show cached source Open source URL	Sumarah, M.W., Puniani, E., Sørensen, D., Blackwell, B.A., and Miller, J.D. (2009). "Characterization of metabolites from red spruce endophytes by LC-MS-SPE/NMR.", Gordon Research Conference on Mycotoxins and Phycotoxins, Colby-Sawyer College, New London, NH, USA, June 21-26, 2009.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	Sumarah, M.W., Puniani, E., Sørensen, D., Blackwell, B.A., et Miller, J.D. (2009). « Characterization of metabolites from red spruce endophytes by LC-MS-SPE/NMR. », Gordon Research Conference on Mycotoxins and Phycotoxins, Colby-Sawyer College, New London, NH, USA, June 21-26, 2009. (Affiche)

Cao, Rong, Ph.D. - Agri...

Show text Show cached source Open source URL	"Screening and Structural Characterization of α-Glucosidase Inhibitors from Hawthorn Leaf Flavonoids Extract by Ultrafiltration LC-DAD-MSn and SORI-CID FTICR MS.", Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 20(8), pp. 1496-1503.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	Li, H., Song, F., Xing, J., Tsao, R., Liu, Z.-Q., et Liu, S.-Y. (2009). « Screening and Structural Characterization of α-Glucosidase Inhibitors from Hawthorn Leaf Flavonoids Extract by Ultrafiltration LC-DAD-MSn and SORI-CID FTICR MS. », Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 20(8), p. 1496-1503. doi : 10.1016/j.jasms.2009.04.003

Kirby, Christopher W., ...

Show text Show cached source Open source URL	"Isolation and structural characterization of unusual pyranoanthocyanins and related anthocyanins from Staghorn sumac (Rhus typhina L.) via UPLC–ESI-MS, 1H, 13C, and 2D NMR spectroscopy.", Phytochemistry.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	Kirby, C.W., Wu, T., Tsao, R., et McCallum, J.L. (2013). « Isolation and structural characterization of unusual pyranoanthocyanins and related anthocyanins from Staghorn sumac (Rhus typhina L.) via UPLC–ESI-MS, 1H, 13C, and 2D NMR spectroscopy. », Phytochemistry. doi : 10.1016/j.phytochem.2013.06.017

Screening and Structura...

Show text Show cached source Open source URL	"Screening and Structural Characterization of α-Glucosidase Inhibitors from Hawthorn Leaf Flavonoids Extract by Ultrafiltration LC-DAD-MSn and SORI-CID FTICR MS.", Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 20(8), pp. 1496-1503.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	Li, H., Song, F., Xing, J., Tsao, R., Liu, Z.-Q., et Liu, S.-Y. (2009). « Screening and Structural Characterization of α-Glucosidase Inhibitors from Hawthorn Leaf Flavonoids Extract by Ultrafiltration LC-DAD-MSn and SORI-CID FTICR MS. », Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 20(8), p. 1496-1503. doi : 10.1016/j.jasms.2009.04.003 Accès au texte intégral (en anglais seulement)

Monreal, Carlos, Ph.D. ...

Show text Show cached source Open source URL	McRae, G. and Monreal, C.M. (2011). "LC-MS/MS quantitative analysis of reducing carbohydrates in soil solutions extracted from crop rhizospheres.", Analytical and Bioanalytical Chemistry, 400(7), pp. 2205-2215.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	McRae, G. et Monreal, C.M. (2011). « LC-MS/MS quantitative analysis of reducing carbohydrates in soil solutions extracted from crop rhizospheres. », Analytical and Bioanalytical Chemistry, 400(7), p. 2205-2215. doi : 10.1007/s00216-011-4940-4

Monreal, Carlos, Ph.D. ...

Show text Show cached source Open source URL	McRae, G. and Monreal, C.M. (2011). "LC-MS/MS quantitative analysis of reducing carbohydrates in soil solutions extracted from crop rhizospheres.", Analytical and Bioanalytical Chemistry, 400(7), pp. 2205-2215.
Compare text pages Compare HTM pages Open source URL Open target URL Define agr.ca as primary domain	McRae, G. et Monreal, C.M. (2011). « LC-MS/MS quantitative analysis of reducing carbohydrates in soil solutions extracted from crop rhizospheres. », Analytical and Bioanalytical Chemistry, 400(7), p. 2205-2215. doi : 10.1007/s00216-011-4940-4

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Sumarah, Mark, PhD - Ag...

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AcMNPV EXON0 (AC141) wh...

The Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) encoded protein, EXON0 (AC141), is required for the efficient transport of nucleocapsids out of the nucleus for the production of budded virus (BV). To further elucidate the molecular mechanisms by which EXON0 regulates BV production, EXON0 was tagged at the N-terminus with 3× FLAG-6× His.

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La protéine EXON0 (AC141) du virus Autographa californica de la polyhédrose nucléaire multiple (AcMNPV) est nécessaire au transport des nucléocapsides à l’extérieur du noyau, lors de la production des virions bourgeonnants (BV). Pour mieux comprendre les mécanismes moléculaires par lesquels EXON0 influe sur la production des BV, nous avons marqué l’extrémité N terminale de la protéine avec l’étiquette 3× FLAG-6× His. Les complexes protéiques ont été isolés au moyen de la purification par affinité en tandem, après quoi ils ont été purifiés sur gel et identifiés par CPL SM/SM. L’analyse a révélé que la protéine cellulaire β-tubuline a été co-purifiée avec la protéine EXON0, ce qui a été confirmé par co-immunoprécipitation. De plus, l’immunofluorescence a montré que la protéine EXON0 et la β-tubuline étaient co-localisées durant l’infection virale. La colchicine et le nocodazole, des inhibiteurs de microtubules, ont été utilisés pour traiter les cellules Sf9 infectées par le virus AcMNPV. Les résultats ont montré que la production de BV a été réduite de plus de 85 %. Ces données semblent indiquer que les interactions entre la protéine EXON0, la β-tubuline et les microtubules faciliteraient le bourgeonnement des virions AcMNPV.

Simultaneous isolation ...