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En salud, las tasas de cobertura de inmunización varían desde 89% para tuberculosis y 85% para sarampión y hepatitis B a 12% para tétanos. Según la ENH 2005-2006, la malaria (60,8%) es aún la enfermedad mortal de más prevalencia, seguida por las infecciones respiratorias (14,2%), diarrea (9,5%, con un porcentaje más alto en áreas rurales) e infecciones cutáneas (3,2%). La tasa de mortalidad infantil descendió de 88,4% a 76%. La mortalidad maternal por cada 100.000 nacidos vivos disminuyó de 505 a 435 y la proporción de partos atendidos por personal de salud especializado aumentó de 39% a 41,1%. En la lucha contra el VIH/SIDA y otras enfermedades de transmisión sexual, el uso de condones entre las personas de más alto riesgo (de 15 a 24 años de edad) aumentó de 49,8% a 52,9%, en tanto la tasa de prevalencia de uso de anticonceptivos entre mujeres de 15 a 49 años, que son más vulnerables a contraer una infección, era de 23,6%.
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